SYK

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1A81, 1CSY, 1CSZ, 1XBA, 1XBB, 1XBC, 3BUW, 3EMG, 3FQE, 3FQH, 3FQS, 3SRV, 3TUB, 3TUC, 3TUD, 3VF8, 3VF9, 4DFL, 4DFN, 4F4P, 4FL1, 4FL2, 4FL3, 4FYN, 4FYO, 4FZ6, 4FZ7, 4GFG, 4I0R, 4I0S, 4I0T, 4PUZ, 4PV0, 4PX6, 4RX7, 4RX8, 4RX9, 5CXH, 5CXZ, 5CY3, 4XG6, 4XG2, 4XG3, 4XG8, 4XG7, 4YJR, 4YJP, 5C27, 4RSS, 4XG4, 5C26, 4YJV, 4YJO, 4WNM, 4YJT, 4YJU, 4YJS, 4XG9, 5GHV

Ідентифікатори

Символи

SYK, p72-Syk, spleen tyrosine kinase, spleen associated tyrosine kinase, IMD82

Зовнішні ІД

OMIM: 600085 MGI: 99515 HomoloGene: 2390 GeneCards: SYK

Пов'язані генетичні захворювання

цукровий діабет 2-го типу, розсіяний склероз, vascular dementia^[1]

Реагує на сполуку

entospletinib, tamatinib^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• kinase activity • ATP binding • protein kinase activity • non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • transferase activity • integrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine kinase activity • protein kinase binding • nucleotide binding • phosphatase binding • Toll-like receptor binding • phosphotyrosine residue binding • SH2 domain binding • interleukin-15 receptor binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • клітинне ядро • early phagosome • B cell receptor complex • клітинна мембрана • T cell receptor complex • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• leukocyte cell-cell adhesion • адаптивна імунна відповідь • positive regulation of receptor internalization • neutrophil activation involved in immune response • platelet activation • Fc-epsilon receptor signaling pathway • protein phosphorylation • cell surface receptor signaling pathway • regulation of DNA-binding transcription factor activity • serotonin secretion • Ангіогенез • animal organ morphogenesis • positive regulation of cell adhesion mediated by integrin • проліферація • regulation of platelet aggregation • B cell receptor signaling pathway • positive regulation of calcium-mediated signaling • blood vessel morphogenesis • Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • serotonin secretion by platelet • cellular response to low-density lipoprotein particle stimulus • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • lymph vessel development • neutrophil chemotaxis • macrophage activation involved in immune response • defense response to bacterium • positive regulation of alpha-beta T cell proliferation • regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • protein autophosphorylation • leukotriene biosynthetic process • GO:0022415 viral process • positive regulation of alpha-beta T cell differentiation • cellular response to molecule of fungal origin • regulation of neutrophil degranulation • фосфорилювання • процес імунної системи • positive regulation of B cell differentiation • beta selection • leukocyte activation involved in immune response • peptidyl-tyrosine autophosphorylation • integrin-mediated signaling pathway • regulation of superoxide anion generation • enzyme linked receptor protein signaling pathway • GO:0007243 intracellular signal transduction • receptor internalization • positive regulation of bone resorption • positive regulation of mast cell degranulation • regulation of arachidonic acid secretion • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • peptidyl-tyrosine phosphorylation • regulation of phagocytosis • regulation of platelet activation • positive regulation of gamma-delta T cell differentiation • positive regulation of type I interferon production • inflammatory response • вроджений імунітет • collagen-activated tyrosine kinase receptor signaling pathway • positive regulation of peptidyl-tyrosine autophosphorylation • protein import into nucleus • positive regulation of interleukin-4 production • interleukin-2-mediated signaling pathway • interleukin-3-mediated signaling pathway • positive regulation of cold-induced thermogenesis • positive regulation of protein-containing complex assembly • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6850


20963

Ensembl


ENSG00000165025


ENSMUSG00000021457

UniProt


P43405


P48025

RefSeq (мРНК)


NM_001135052 NM_001174167 NM_001174168 NM_003177


NM_001198977 NM_011518

RefSeq (білок)


NP_001128524 NP_001167638 NP_001167639 NP_003168


NP_001185906 NP_035648

Локус (UCSC)

Хр. 9: 90.8 – 90.9 Mb

Хр. 13: 52.74 – 52.8 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SYK (англ. Spleen associated tyrosine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 635 амінокислот, а молекулярна маса — 72 066^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASSGMADSA	NHLPFFFGNI	TREEAEDYLV	QGGMSDGLYL	LRQSRNYLGG
FALSVAHGRK	AHHYTIEREL	NGTYAIAGGR	THASPADLCH	YHSQESDGLV
CLLKKPFNRP	QGVQPKTGPF	EDLKENLIRE	YVKQTWNLQG	QALEQAIISQ
KPQLEKLIAT	TAHEKMPWFH	GKISREESEQ	IVLIGSKTNG	KFLIRARDNN
GSYALCLLHE	GKVLHYRIDK	DKTGKLSIPE	GKKFDTLWQL	VEHYSYKADG
LLRVLTVPCQ	KIGTQGNVNF	GGRPQLPGSH	PATWSAGGII	SRIKSYSFPK
PGHRKSSPAQ	GNRQESTVSF	NPYEPELAPW	AADKGPQREA	LPMDTEVYES
PYADPEEIRP	KEVYLDRKLL	TLEDKELGSG	NFGTVKKGYY	QMKKVVKTVA
VKILKNEAND	PALKDELLAE	ANVMQQLDNP	YIVRMIGICE	AESWMLVMEM
AELGPLNKYL	QQNRHVKDKN	IIELVHQVSM	GMKYLEESNF	VHRDLAARNV
LLVTQHYAKI	SDFGLSKALR	ADENYYKAQT	HGKWPVKWYA	PECINYYKFS
SKSDVWSFGV	LMWEAFSYGQ	KPYRGMKGSE	VTAMLEKGER	MGCPAGCPRE
MYDLMNLCWT	YDVENRPGFA	AVELRLRNYY	YDVVN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, ангіогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

Yagi S., Suzuki K., Hasegawa A., Okumura K., Ra C. (1994). Cloning of the cDNA for the deleted syk kinase homologous to ZAP-70 from human basophilic leukemia cell line (KU812). Biochem. Biophys. Res. Commun. 200: 28—34. PMID 7513161 DOI:10.1006/bbrc.1994.1409
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Mueller B., Cooper L., Terhorst C. (1994). Molecular cloning of the human homologue to the pig protein-tyrosine kinase syk. Immunogenetics. 39: 359—362. PMID 8168854 DOI:10.1007/BF00189234
Deckert M., Tartare-Deckert S., Couture C., Mustelin T., Altman A. (1996). Functional and physical interactions of Syk family kinases with the Vav proto-oncogene product. Immunity. 5: 591—604. PMID 8986718 DOI:10.1016/S1074-7613(00)80273-3
Law C.L., Chandran K.A., Sidorenko S.P., Clark E.A. (1996). Phospholipase C-gamma1 interacts with conserved phosphotyrosyl residues in the linker region of Syk and is a substrate for Syk. Mol. Cell. Biol. 16: 1305—1315. PMID 8657103 DOI:10.1128/MCB.16.4.1305
Deckert M., Elly C., Altman A., Liu Y.C. (1998). Coordinated regulation of the tyrosine phosphorylation of Cbl by Fyn and Syk tyrosine kinases. J. Biol. Chem. 273: 8867—8874. PMID 9535867 DOI:10.1074/jbc.273.15.8867

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SYK переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з SYK переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11491 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P43405 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.