ACKR1

ACKR1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4NUU, 4NUV

Ідентифікатори
Символи ACKR1, atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group), CCBP1, CD234, Dfy, FY, GPD, GpFy, WBCQ1, DARC, DARC/ACKR1
Зовнішні ІД OMIM: 613665 MGI: 1097689 HomoloGene: 48067 GeneCards: ACKR1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• C-C chemokine binding
• G protein-coupled receptor activity
• transmembrane signaling receptor activity
• signal transducer activity
• chemokine binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• signaling receptor activity

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• recycling endosome
• ендосома
• клітинна мембрана
• early endosome
• мембрана

Біологічний процес

• chemokine-mediated signaling pathway
• regulation of chemokine production
• G protein-coupled receptor signaling pathway
• defense response
• inflammatory response
• GO:0072468 сигнальна трансдукція

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2532
13349
Ensembl
ENSG00000213088
ENSMUSG00000037872
UniProt
Q16570
Q9QUI6
RefSeq (мРНК)
NM_002036
NM_001122951
NM_010045
RefSeq (білок)
NP_001116423
NP_002027
NP_034175
Локус (UCSC) Хр. 1: 159.2 – 159.21 Mb Хр. 1: 173.16 – 173.16 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ACKR1 (англ. Atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 336 амінокислот, а молекулярна маса — 35 553[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGNCLHRAELSPSTENSSQLDFEDVWNSSYGVNDSFPDGDYGANLEAAAP
CHSCNLLDDSALPFFILTSVLGILASSTVLFMLFRPLFRWQLCPGWPVLA
QLAVGSALFSIVVPVLAPGLGSTRSSALCSLGYCVWYGSAFAQALLLGCH
ASLGHRLGAGQVPGLTLGLTVGIWGVAALLTLPVTLASGASGGLCTLIYS
TELKALQATHTVACLAIFVLLPLGLFGAKGLKKALGMGPGPWMNILWAWF
IFWWPHGVVLGLDFLVRSKLLLLSTCLAQQALDLLLNLAEALAILHCVAT
PLLLALFCHQATRTLLPSLPLPEGWSSHLDTLGSKS

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

  • Tournamille C., Colin Y., Cartron J.-P., Le van Kim C. (1995). Disruption of a GATA motif in the Duffy gene promoter abolishes erythroid gene expression in Duffy-negative individuals. Nat. Genet. 10: 224—228. PMID 7663520 DOI:10.1038/ng0695-224
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Bonecchi R., Savino B., Borroni E.M., Mantovani A., Locati M. (2010). Chemokine decoy receptors: structure-function and biological properties. Curr. Top. Microbiol. Immunol. 341: 15—36. PMID 20373092 DOI:10.1007/82_2010_19
  • Novitzky-Basso I., Rot A. (2012). Duffy antigen receptor for chemokines and its involvement in patterning and control of inflammatory chemokines. Front. Immunol. 3: 266—266. PMID 22912641 DOI:10.3389/fimmu.2012.00266
  • Graham G.J., Locati M., Mantovani A., Rot A., Thelen M. (2012). The biochemistry and biology of the atypical chemokine receptors. Immunol. Lett. 145: 30—38. PMID 22698181 DOI:10.1016/j.imlet.2012.04.004
  • Cancellieri C., Vacchini A., Locati M., Bonecchi R., Borroni E.M. (2013). Atypical chemokine receptors: from silence to sound. Biochem. Soc. Trans. 41: 231—236. PMID 23356288 DOI:10.1042/BST20120246

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4035 (англ.) . Архів оригіналу за 28 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q16570 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350